甲亢并发症其实跟甲亢有关，最常见的并发症是心脏，可以出现心律失常，可以出现心衰，可以出现心脏扩大，严重可能出现充血性心力衰竭，往往老年患者若基础有冠心病，可能出现顽固心律失常或顽固心衰。除了心脏的并发症，还有神经肌肉的并发症，有青年男性在甲亢还没有被确诊之前，可能出现周期性麻痹，如早晨起床起不来，两个腿不能动。

还有并发症表现在肝脏，有的病人如果甲亢没有被诊断，或诊断以后没有很好的治疗，迁延不愈，出现肝脏损害，有的患者可以出现转氨酶明显增高以及黄疸，有的甚至因为黄疸去就诊传染病医院，以为是重症肝炎。其它还有血液系统的表现，其实也是甲亢对全身系统的影响。