艾灸神阙穴治疗咳嗽没有直接治疗的作用，因为神阙穴还是主下焦。一般肾阳不足、女性宫寒一般用神阙穴，或者针对脾虚、脾肾阳虚腹泻也可以用神阙穴，真正治咳嗽时很少用到神阙穴。
也可以辅助治疗痰湿比较重或者肺脾两虚、肾阳虚，一般不是咳嗽而是喘，偶尔可能用到下面的穴位，如神阙穴、关元穴、气海穴，但也是辅助治疗。
主要治疗肺的艾灸穴位一般都在上面，这也是容易熏到肺的原因，比如膻中穴以上的穴位，在任脉上膻中穴以上一直到天突穴，中间的这一条穴位，包括玉堂穴、华盖穴、紫宫穴、璇玑穴这几个穴位，都是管肺的咳嗽、喘。所以要是在这艾灸，味道会直接熏进肺，等于让肺吸进去，所以不太合适。
通常如果艾灸是艾灸后面的肺俞穴、大抒穴、风门穴、大椎穴这几个穴位，所以真正用到神阙穴的不多，就是痰湿咳嗽有时需要艾灸，用艾柱隔姜灸在上脘穴、中脘穴、下脘穴这几个穴位时，可以配合神阙穴，对扶助脾胃的阳气特别好，治疗痰湿咳嗽时也有采用这种方法。
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