C14幽门螺杆菌阳性需要根据具体数值决定严重程度，C14尿素呼气试验正常值是0-100dpm，部分化验是0-50dpm。按比例100-200dpm属于轻度即2倍以下，2-5倍中度，5倍以上为重度，根据该数值进行根除治疗。
重度选择四联疗法14天，中度选择三联疗法14天或四联疗法10天左右，轻度可以酌情根除或不进行根除。临床症状显示越少根除效果越差，同时存在部分病人越治疗幽门螺杆菌，反而增多，无法解释。
幽门螺杆菌按疗程服用药物后，需要停药28天进行复查，不可间隔太长，且该期间不要随意服用抗生素与奥美拉唑类质子泵抑制剂，检查结果可准确反映根除疗效，即根除或具有耐药性。同时需要通过上述结果判断，指导根除失败的病人进行下次治疗。
