重症肌无力可以累及全身骨骼肌，但在发病早期可以单独出现眼外肌、咽喉肌或肢体肌肉无力。头面部神经支配肌肉，比脊髓神经支配的肌肉更容易受累，经常从一组肌肉无力开始逐渐累及到其他肌肉，直到全身肌肉无力。最常见的首发症状是眼肌无力，常见于90%以上的重症肌无力患者，患者可以出现交替性的上睑下垂、双侧的上睑下垂、眼球活动障碍等。出现看东西双影，即医学上的复视。

面肌受累可以出现鼓腮漏气、眼睑闭合不全、鼻唇沟变浅、苦笑或者呈疾病面容。咀嚼肌受累以后可以导致咀嚼困难。咽喉肌受累出现发音不清、吞咽困难、说话鼻音、饮水呛咳以及声音嘶哑等。颈肌受累出现头颈部活动障碍、患者抬头困难、肢体各组的肌群均可以出现肢体无力症状，以肢体近端无力为主。部分患者短期内可以出现全身肌肉收缩无力，甚至发生肌无力危象。如果肋间肌和膈肌受累以后，病人会出现呼吸困难、骨骼肌无力，其有易波动性和易疲劳性，活动后加重、休息后可以减轻。比如眼外肌无力，病人在经过一晚上的休息以后可以减轻，随着时间的延长症状会逐渐加重。

根据以上不同的临床表现，可以分为五个类型，第Ⅰ型是眼肌型，第Ⅱ型是全身型，有一组以上的肌群受累。Ⅲ型是重度激进型，这种类型发病比较急、进展比较快，发病在数周到数月以内就可累及到咽喉肌，半年以内累及呼吸肌。第Ⅳ型是迟发的重症型，该类型是隐袭起病缓慢进展的，在2年内逐渐进展，一般由Ⅰ型和Ⅱ型进展而来，累及到呼吸肌。Ⅴ型是肌萎缩型，在起病半年以内可以出现骨骼肌的萎缩和无力。