甲状腺功能亢进简称甲亢，是一种自身免疫性疾病。但这种自身免疫性疾病实际是一种器官自身免疫疾病，即这种疾病只是甲状腺产生自身免疫的反应，不会累及全身其他器官。甲亢的发病机制主要与机体免疫状态失衡有关，免疫状态失衡，可能是机体受外因或内因影响，导致体内产生一种甲状腺受体的刺激性抗体，即TRAb(促甲状腺素受体抗体)。这种抗体主要作用在甲状腺滤泡的TSH(促甲状腺激素)受体，刺激甲状腺滤泡增生，导致甲状腺肿大，从而导致甲状腺滤泡合成甲状腺激素的功能亢进，即甲亢。

甲亢的根本发病机制跟抗体刺激有关，所以也称为自身免疫性疾病。但因为这种抗体主要作用在甲状腺组织，不会对机体其他组织造成免疫损害，所以甲亢也称为器官免疫性疾病。甲亢患者可能出现甲状腺眼病、相关性眼病或胫前黏液性水肿等现象，也与抗体有关。甲亢的症状与甲状腺密切相关，随着甲状腺治疗的好转，甲亢的症状也会有所改善。