蝶窦囊肿不会癌变。蝶窦囊肿大部分是蝶窦的慢性炎症刺激造成。炎症刺激会产生黏液性、水性的分泌物，当分泌物不能及时排放到窦腔以外，就会在局部形成黏液潴留，从而形成蝶窦囊肿。
蝶窦囊肿本身是良性病变，只要把囊肿切除，有的人会出现复发，有的人不会复发，但是不会出现恶变和转移，如不会出现局部转移、淋巴结转移，或者是远处转移。如果蝶窦里边有癌变的组织，由于现在大部分上颌窦癌的病因并不明确，可能是吸烟、饮酒、受刺激性物质刺激所致。
另外，也可能是刺激性化学试剂的刺激，比如油漆工人经常闻油漆，油漆里边含有苯类的芳香族化学试剂，可能会引起鼻腔以及鼻窦黏膜发生恶变的风险。
