复杂性肛瘘的症状主要包括以下方面，复杂性肛瘘说明它存在多个管道或外口，肛瘘反复发作，所以复杂性肛瘘最重要的特点是反复发作性。总有人不认识、认识不到或者不重视，有时觉得肛门肿了吃消炎药就好，过段时间又出现肿、流脓流水的症状，流完脓水后又不重视，所以反反复复的发作是复杂性肛瘘最主要的症状。复杂性肛瘘的症状都较重，本身存在瘘管比较难受，又流脓流血，脓血出不来时肿疼，多个瘘管的肿痛与流脓症状是非常重的。还有大家可以自己摸到的肿块，包括条索越来越多、肿块越来越大，条索可能今天发作一根，下次发作可能两根，再下次可能三根。最多的一个瘘管有七根条索，这就是非常复杂的肛瘘了。所以复杂性肛瘘最主要的症状是反复发作、反复肿痛、流脓血。而且包块越来越大、越来越多，以上为复杂性肛瘘的症状。
