自免脑炎在临床上一般是指自身免疫性脑炎，是可治性疾病，在医学科学发展到现在，绝大多数的自身免疫性脑炎都可以被治疗，也有被治愈的可能。也有一些脑炎不好治愈，主要与自身免疫性脑炎的分类有明确的关系。自身免疫性脑炎可以分为抗神经元表面抗原和神经元核内抗原脑炎。具体情况如下：

1、抗神经元表面抗体脑炎：以抗NMDAR受体脑炎和抗LGI1脑炎为代表，发病率较高，较为常见。部分合并肿瘤，相当多不合并肿瘤。经过规范的免疫治疗、抗癫痫治疗和对症支持治疗，多数患者可以逐渐恢复正常，甚至不遗留明显的后遗症。也有重症的抗NMDAR受体脑炎患者，恢复不太好，可能会危及生命，但总体而言还是有治愈可能；

2、神经元核内抗原脑炎：这类脑炎以抗GABAR脑炎为代表，通常是合并肿瘤，也称为副肿瘤综合征。这类脑炎由于有恶性肿瘤参与，症状较重、疗程较长，整体恢复较差。即使是脑炎症状改善，恶性肿瘤有时也会危及到生命，而导致预后不好。

除脑炎类型以外，患者本身的状态。以及基础病、年龄，也决定能否完全治愈。如果是年轻患者，身体底子较好，没有合并明显的并发症，如肺部感染、心功能不全等，还是有治愈的机会。如果是年龄较大的患者，有很多基础病和并发症，恢复便比较困难，可能不好治愈。