早晨起来如果咳嗽有痰，多见于呼吸道有问题，包括上呼吸道、下呼吸道。上呼吸道是鼻部、咽喉、鼻咽喉，下呼吸道是气管、支气管，再远端是肺泡，如果肺泡有疾病，也会出现咳嗽和咳痰。

现在也没有明确容易导致早起咳嗽、咳痰的疾病，如果出现晨起咳嗽、咳痰，是呼吸道某一部分出现疾病的表现，但单通过症状并不能够直接推论，还需要去医院接受进一步检查，包括气道、肺部甚至胸膜，根据临床检验证据推论导致晨起出现咳嗽有痰的原因。