清理肠道，通常是应用清肠药物，即泻药进行清理。在肠镜或者手术前，可能需要清理肠道。目前主要应用聚乙二醇，是较为常用的清理肠道药物，通常较为安全，清肠效果也较好。在肠镜前，或者进行手术前的肠道准备，需要饮用3000-4000ml的聚乙二醇，帮助清空肠道，排出肠内容物。清肠药物还包括以前的硫酸镁、甘露醇，以及新兴的磷酸钠等，但是目前都较少应用，主要还是以聚乙二醇为主。
另外除上述用药以外，在清肠前还需要注意饮食。如果就近日饮食过于油腻，蔬菜摄入过多，可能清肠的效果欠佳。所以在肠镜或者手术前2-3天，最好避免进食过多油腻食物、不易消化的食物或者过多蔬菜。在前一天晚上，更需要以清淡的粥为主，有利于肠道清理，手术效果和肠镜检查的效果才会更加理想。
