阴茎癌在龟头，也就是阴茎头，最早期的表现是局部皮肤增厚，这时候通常容易被忽视，从而漏诊。随着疾病进一步发展，会发生在阴茎头和包皮局部的丘疹破溃，以及菜花样的隆起。

病变进一步加深，就会形成溃疡面或者破溃，破溃边缘是硬而不规则，表面常有脓性分泌物产生，呈恶臭味，局部会逐步出现菜花样肿物。菜花样肿物逐渐增大，表面污秽、凹凸不平，常侵犯到尿道海绵体或者阴茎海绵体，会造成排尿困难的症状。

随着疾病发展，病变除在局部进展以外，最重要的是发生转移。阴茎癌的转移，最常见的转移部位是腹股沟浅深淋巴结的转移，进一步转移到腔外淋巴结，也有直接进入到深部淋巴结，或者腔外淋巴结。

出现淋巴结转移或者淋巴结肿大，要跟是否合并感染进行鉴别，因为有一半是感染性因素，另外一半是转移性因素，转移进一步发展，转移灶和原发灶都可以出现破溃、感染出血。远处器官转移发生以后，就会出现转移器官的相应并发症。

同时患者会出现全身的消耗症状，如恶病质、贫血及蛋白血症、全身衰竭等。有一部分阴茎癌患者会出现高钙血症，可能跟腹股沟淋巴结转移有关，行转移灶切除以后，高钙血症就会消失。