青光眼手术方法多种多样，手术时间有所不同。下面就以经典的复合小梁切除术为例，通常需要45分钟，这个时间从手术医生开始为患者实施麻醉开始计算，到手术完成、手术结束。患者进入手术室之后需要接受术前核对信息、洗眼、消毒等流程，因而患者及家属感受到的时间肯定相应延长。
其他的滤过性手术，手术时间可能在45分钟的基础上相应延长或者缩短。另外，手术医生个人的情况可能导致手术时间有所不同。周边虹膜切除术是预防性手术，手术时间比较短，大约数分钟之内即可完成。当然青光眼的手术时间不是决定手术效果的唯一因素，应该以手术效果为准。
