输卵管堵塞不会影响卵巢，卵巢的功能是排卵及分泌性激素，卵巢是否排卵与输卵管毫不相干。但当盆腔有炎症时，可能破坏卵巢的血运，这种情况下既会造成输卵管堵塞，也会造成卵巢分泌性激素异常而发生排卵的障碍。但是这两个状况都是因为炎症所致，而不是因为输卵管堵塞导致卵巢出现问题。
女性生殖器包括子宫、输卵管和卵巢，子宫是孕育胎儿的地方，输卵管是女性盆腔内一对细长的管腔，卵巢是女性盆腔内左右各一的性腺。输卵管是精子和卵子相遇的通道，其功能是运输精子和卵子，并使精子和卵子在输卵管受精。卵巢会分泌性激素，即雌激素；当卵泡生长，女性排卵以后会形成黄体而产生孕激素，所以输卵管和卵巢是两个器官。
