40天宝宝晚上哭闹剧烈，常见原因如下：

1、胃肠道异常：宝宝出生后由于肠道菌群发育不完善、肠道蠕动功能较差、发生乳糖不耐受或牛奶蛋白过敏，出现消化不良时，表现为腹胀、腹泻或呕吐。当宝宝在40天左右会出现肠绞痛，表现为哭闹，尤其在傍晚时会出现明显哭闹，此时可给予宝宝抚触，必要时服用益生菌以缓解肠绞痛；

2、缺乏维生素D或钙：在宝宝出生后2周需补充足量维生素D或钙，如果维生素D补充不足，可导致钙磷吸收减少，从而出现低钙情况。而钙有营养神经作用，当维生素D补充不足时可能会出现哭闹情况，需给予宝宝补充维生素D，防止出现低钙现象；

3、其他原因：当宝宝出现哭闹时，需注意有无疾病影响，如发烧、咳嗽引起肺炎等，需给予积极治疗。当40天宝宝哭闹严重时需进行全面检查，如头部有无湿疹、结痂，或全身有无湿疹、脓疱疹，以及会阴部、外阴有无红肿等，必要时需及时就诊，可根据不同病情给予治疗。