子宫内膜异位症常见临床表现是痛经、慢性盆腔痛、月经异常和不孕症。子宫内膜异位症的痛经常发生在月经开始前1-2日并持续整个月经周期，发生部位是下腹深部、腰骶部，并向肛门、会阴、大腿放射。疼痛特点是开始可能无疼痛，随着时间推移逐渐出现疼痛且加重，开始服用止痛药可能有效，但随着时间推移，可能止痛药加量效果仍欠佳。
患者通常是由于异位病灶内部出血，刺激局部周围组织炎性反应引起痛经，常与病灶大小不一致，也与月经周期不符，有时持续性疼痛，仅在月经期加重。可用药物止疼，也可放置曼月乐，曼月乐分泌孕激素造成病灶萎缩，可缓解疼痛。
