最常见的化验大便的方法是大便常规化验，留取粪便标本以后，检验人员要观察大便的外观、颜色、性状等。此外需要在显微镜下，观察大便有没有微生物及寄生虫虫卵。
另外还要看大便有没有红细胞、白细胞，以及有没有含铁成分过高，即检测是否有潜血存在。通过上述的化验，反映肠道内或者消化道内有没有存在异常情况。
现在还可以通过大便检测肠道炎症的情况，如检测大便内的钙卫蛋白来反映疾病，如炎症性肠病的活动程度。也可以通过大便，检测幽门螺杆菌感染的状况。
通过大便还有更多的检测项目，现在有公司开发出一个试剂盒，可以通过大便检测是否有早期肠癌的风险。此外也可以通过大便做科学研究，研究肠道菌群的变化等。
所以对于大便的检测方法现在非常多，有些在临床上已经可以开展，有些还局限于临床实验室。通过技术改进，将来也有可能会在临床上开始使用，为诊断提供更多的线索和参考意义。
