试管婴儿进行胚胎移植，即将胚胎放入子宫，大部分女性对该过程没有任何感觉。因为胚胎移植时，所使用的移植管非常柔软、非常细，并且进行移植的操作人员，均是经验非常丰富的医生与技术人员。此外还有工作人员来做超声，在超声引导下进行胚胎移植。
胚胎移植所使用的胚胎移植管，其材料非常柔软，而且移植管头部设计非常圆润，同时女性宫颈口本身就有一定松度，可以容纳移植管进入，因此进行胚胎移植时通常没有任何感觉。移植管进入宫颈口后，前进速度也会比较缓慢，而且在B超引导下，可以明确看到移植管进入的位置，以及距离宫底的距离。医生会在超声引导下，找到相对比较好的内膜厚度，在距离宫底1.5cm左右的位置进行胚胎移植。含胚胎的培养基体积非常小，医生会缓慢将培养基注射到宫腔内，也不会对子宫造成刺激。
