十二指肠炎的发生可能与饮食、生活习惯、环境、遗传、精神压力等因素有关系。包括吸烟、饮酒、刺激性食物，还有腌制食物，不新鲜的食物；药物主要包括非甾体抗炎药，刺激性的中草药等；还有放射线照射。另外，胃内的幽门螺旋杆菌感染、精神紧张、劳累、压力过大，应激都可以引起十二指肠的炎症。幽门螺旋杆菌感染，其中是其重要的病因，可以反复引起胃、十二指肠的炎症、溃疡等病变，尤其是当季节交替、冷热交替的时候，特别容易出现胃和十二指肠及消化性溃疡的发生。严重的患者可以出现消化道出血，以及穿孔等并发症。
所以十二指肠炎，尤其是有十二指肠球部溃疡的患者，需要尽早行碳13呼气检测，检测患者是否感染有幽门螺旋杆菌。如果检测结果是阳性，需要进行规范根除幽门螺旋杆菌的治疗，而不能单纯的服用保护黏膜的药物，否则会反复的发生十二指肠球部的炎症及溃疡。
