房间隔缺损介入封堵术风险取决于病情的程度和房间隔缺损的部位，中央型、上腔型或者下腔型，还取决于手术医生的习惯、技术及熟练程度。如果是中央型房间隔缺损，缺损不大，位置很好，周围边缘较厚实，医生技术也较好、操作非常熟练，这种情况一般没有太大的风险。
但如果房间隔缺损较大，靠近上腔或下腔，放封堵器有可能会脱落，这种情况比较危险，最好不要采取上腔和下腔型的封堵。如果医生的技术相对不完美，或者不熟练，这种情况也会增加一定的手术风险。所以，做手术首先要选择手术时机，选择可信赖、技术较好、较成熟的医生，能把风险降到最低。
