胶囊胃镜本身具有一定的局限性，只能观察胃以下以及结肠以上这部分肠道的情况。若需进行胃镜、肠镜检查，通常的胃肠镜检查比胶囊胃镜更清晰和准确，具体需根据患者的病情，以及相应的实验室检查最终确定。
胃肠镜胶囊镜在进行胃镜检查时较常用，胶囊胃镜有充足的电力，且患者无明显禁忌证的情况下，均安全可靠。胶囊胃镜为科技进步下的一种新型产物，检查方法为患者将胶囊口服吞下，随着肠道壁的不断蠕动，促使胶囊机器人逐渐向肠道下段运动，在整个运动过程中会自行拍摄肠道内的具体情况。若胶囊胃镜发现相关病变，可根据大致走行位置判断病变的具体位置，但定位不一定准确，可能给临床医生造成一定的困扰。
