头部磁共振对人体无害，没有影响，X线与脑CT均有放射性物质参与，有一定辐射。磁共振利用人体组织，通过磁场持续时间不同进行成像，基于磁场原理无辐射。磁共振为非常绿色 、健康的检查，不但普通人可以做，老人、小孩子、婴幼儿、新生儿、孕妇均可查磁共振。
磁共振的主要问题在于做的时间较长，而且声音有点大，在密闭空间下，部分幽闭恐惧症患者会自觉不适，躺在仪器内喘不上气、难受。但是这类患者较少，大部分患者只要充分沟通到位，坚持躺一会，基本上没有上述反应。总之，不必要为磁共振有无辐射而担心，头部磁共振是非常重要的一项检查，其它检查无法替代，对较多疾病有不可取代作用，头部磁共振没有害处、辐射，可以放心去做。
