如果肾脏内有13毫米的结石，处理选择的办法比较多，每一种办法都有自己的优缺点，所以要结合结石的具体大小、部位以及并发问题，或者患者身体状态和医院的软硬件情况，进行选择。

一般不选择自行排石，因为13毫米的结石无法排除，可以选择体外冲击波碎石。体外冲击波碎石，一般适用于肾中上盏的2厘米以下的结石和1.5厘米以下的下盏结石。但是对于肾结石，体外冲击波碎石进行治疗，通常残留结石的概率最高，而且结石越大，出现石街现象的可能性也就越大。

对于13毫米的结石，推荐行输尿管软镜的手术。输尿管软镜一般适合于20毫米以下的肾结石，输尿管软镜碎石效率高，而且粉碎比较彻底，相对创伤最小。对于20毫米以上的结石，可以选择经皮肾镜。所以13毫米的结石，经皮肾镜的选择就不是特别合适。

在目前由于微创治疗兴起，肾结石的治疗微创技术，主要是输尿管软镜和经皮肾镜技术。现在开放的手术以及腹腔镜手术，只适用于伴随有其他需要处理的泌尿系统疾病的时候，才行传统的开刀手或者腹腔镜手术，其他情况下都不是治疗的主流。