小苏打有治疗霉菌性阴道炎的作用，但目前临床上较少采用小苏打进行治疗。由于临床上有克霉唑片等更特异的治疗霉菌药，小苏打治疗虽然暂时有效，但有可能破坏阴道pH值、破坏阴道菌群，造成菌群紊乱，停药之后出现病情反复，甚至更加严重。因此目前大部分医生不再采用小苏打治疗霉菌，而是采用更特异的药物进行治疗。
霉菌对碱性比较敏感，小苏打属于碱性物质，通过改变阴道pH值杀死霉菌。但通过此种方式杀死霉菌具有一定代价，可能破坏阴道pH值，破坏阴道微环境，停药之后阴道微环境改变，造成霉菌感染的反复发作。如果确诊为霉菌性阴道炎，目前可以选择克霉唑片、达克宁栓、制霉菌素栓等外用抗真菌药物治疗。如果病情较为严重或反复发作，可以加上口服抗真菌药物进行治疗，例如氟康唑、斯皮仁诺等。
