颅内动脉瘤主要生长在动脉分叉部，即动脉发出分支的部位。常见部位是前循环，即颈内动脉系统，后循环叫做椎基底动脉系统。在前循环椎动脉系统里大多数会出现在眼动脉分叉部，后交通动脉分叉部以及终末分支，即分出大脑前动脉和大脑中动脉部位。
大脑中动脉和大脑前动脉各级分叉部也会发生类似动脉瘤生长。在后循环常常表现为夹层动脉瘤和囊性动脉瘤，生长位置也主要位于分叉部位，比如常见的椎动脉动脉瘤、基底动脉间动脉瘤、大脑后动脉分支部位动脉瘤。动脉瘤生长与血流方向有一定关系，在分叉部血流随着冲击形成动脉瘤，生长方向与血流冲击方向一致，动脉瘤部位和日后治疗以及所带来预后都密切相关，也为医生对动脉瘤判断提供重要依据。
