妇科沙眼衣原体多数指的是女性沙眼衣原体感染，属于性传播疾病，主要通过性行为传播，也可能通过间接接触传播，但不是主要的传播疾病。沙眼衣原体感染后，女性可能有症状，部分女性无明显症状。
当沙眼衣原体出现亚临床感染后，长时间的亚临床感染会对女性造成危害。常见的危害是有可能导致慢性的输卵管炎，从而影响女性的生殖力，导致不孕以及异位妊娠。
沙眼衣原体可以感染泌尿系统，导致泌尿系感染，从而引起尿频、尿急、尿痛等表现，也可感染生殖系统，导致急性宫颈炎以及盆腔炎。出现急性宫颈炎时，会表现为宫颈大量的脓性分泌物，出现急性盆腔炎时，可能会引起腹痛和发热的表现。所以，出现沙眼衣原体感染时，无论是否有症状，通常都需要治疗。
