外伤以后导致的血栓形成，其治疗方法跟一般情况导致的血栓形成的治疗方法基本相同。但是有的外伤损伤血管，或者因为骨折损伤而压迫血管，导致血栓形成。此时血栓形成的治疗比较麻烦，不能跟通常的血栓形成同样治疗。首先要把骨折复位、损伤的血管修复，其次通过其他的治疗方法治疗血栓。
一般来说，治疗血栓的主要方法是抗凝和溶栓，必要时可以通过手术的方法来去除血栓。手术方法包括传统的方法取栓，以及微创方法将血栓吸除。有的血栓通过手术也不能去除，可能还需要加强药物治疗。如果血栓不稳定，则有导致肺栓塞的风险，可能需要在下腔静脉放一个下腔静脉的滤网，防止血栓脱落以后而导致危险的后果。
