关于应该在月经周期的第几天去查激素水平，或者去查女性性激素六项，取决于检查的目的，可能是月经前3-5天，也可能是月经前7天，分析如下：

1、月经前3-5天：比如有一些女性，可能会涉及早发性卵巢功能不全，可能会涉及到怀疑是否有卵巢早衰等。当针对于卵巢的基本功能、激素水平分泌状态，需要进行查询时，一般建议在月经的3-5天，也就是卵泡期时，去进行性激素六项测定。另外，还有一些女性，如果是涉及黄体萎缩不全，月经即将干净时淋漓不尽地出血，这个时候，同样也会选择在此期间，去进行激素水平测定。尤其需要看待本来应该是处于卵泡期、没有孕激素水平的测定，这个时候，孕激素水平是否持续偏高。所以，针对于这些检查目的，会选择在月经的第3-5天去抽血检测；

2、月经前7天：还有一种就是希望来检查是否有黄体功能不足所导致的月经周期明显缩短，所导致的月经前淋漓不尽出血，只是一次月经来潮，或者是有一些女性可能有反复性的怀孕早期的流产，甚至不孕症。如果是为了查询黄体功能，一般会选择在月经前7天的时间来进行激素水平测定，因为在卵巢排卵之后，将会有卵巢黄体形成，卵巢黄体能够分泌雌激素和孕激素，而在黄体形成之后的7天，也就是下次月经来潮之前7天左右的时间，应该是黄体最为旺盛的阶段。在这个时候，如果去检测孕激素，可能就会发现有一些女性可能本身就有黄体功能不足，会有黄体提前萎缩，就容易出现黄体功能不足所带来的相应的临床症状。

所以，在月经第几天去进行性激素六项检查，实际上取决于检查目的和医生对于不同的症状、不同的体征心理上的判断，然后才能够给予患者或者女性更好的指导性的意见。