卵巢囊肿主要包括生理性囊肿和病理性囊肿，发病原因如下：

1、生理性卵巢囊肿：指卵巢瘤样改变，比如卵泡囊肿或滤泡囊肿、黄体囊肿，是由于卵巢的卵泡持续性增大但没有排卵，或者排卵后形成的黄体所导致。属于生理性变化的过程，不会引发健康问题，也很少会导致腹痛、腹胀或不适，一般在2-3个月经周期后可自行消失；

2、病理性卵巢囊肿：主要包括输卵管或卵巢囊肿、炎性积液以及卵巢肿瘤，即通常说的卵巢赘生性囊肿，赘生性囊肿又包括卵巢良恶性肿瘤。研究认为持续的卵巢上皮发生基因突变，从而导致卵巢囊肿的发生，可能与遗传和家族性因素有关。卵巢发生赘生性囊肿时一定要及时就诊，判断囊肿是否需要手术治疗。