临床上牙齿上出现黑洞的原因不同，处理的方式也不同，具体情况如下：

1、蛀牙：医学上称为龋齿，是细菌对局部牙釉质破坏，从而形成牙齿表面上的黑洞。此时应由专业口腔内科医生对局部细菌所侵犯的牙体结构进行彻底清理，再使用牙科材料进行牙体修补；

2、黑色素沉积：牙齿表面有黑色色素沉着时，经过牙齿的洁治，可以起到较好的效果；

3、黑色病损：发生在磨牙颌面的黑色病损，主要表现为窝沟内有部分黑色色素沉着，此时易与龋齿相混淆，应尽快找口腔医生进行诊断和鉴别。如果是色素沉着，需要洁治或对其进行清理，之后做必要的窝沟封闭，可以起到较好的效果。