预防隐球菌脑膜炎和预防其它的脑膜炎相似，主要的预防措施如下：
1、增强抵抗力：隐球菌在大气中、空气中、土壤里存在，是条件致病菌。吸入隐球菌后，人体的免疫力强大时能将隐球菌清除，但是免疫力低下时，吸入隐球菌就可能造成肺部的隐球菌感染，然后再通过血液到达脑部，引起隐球菌脑膜炎，所以预防隐球菌脑膜炎需要增强人的抵抗力；
2、减少隐球菌的吸入：禽类的粪便中隐球菌含量很高，潮湿的不通风空气中隐球菌含量高，如果需要在这种环境中工作、生活，就要积极地戴口罩，以减少隐球菌的吸入。
很多隐球菌的病人患病前，都有劳累、工作很压力很大、经常熬夜、生活不规律等降低抵抗力的生活习惯，从而 导致隐球菌的感染发病。有基础病的人群，如有恶性肿瘤、糖尿病或者有免疫疾病的病人，本身抵抗力就很差的情况下，也非常容易感染隐球菌脑膜炎。
