甲硝唑具有抗阿米巴、抗滴虫、抗贾第鞭毛虫、抗厌氧菌等作用。甲硝唑对阴道滴虫有直接的杀灭作用，口服后可以出现于阴道分泌物、精液和尿液中，所以对女性和男性泌尿生殖道滴虫感染有良好的疗效，但是偶也有耐药虫株出现。
阴道炎是阴道黏膜及阴道下结缔组织的炎症，是妇科门诊常见的疾病。正常健康女性由于解剖及生理特点，阴道对病原体的侵入有自然防御的功能，当阴道的自然防御功能遭到破坏，病原体易侵入导致阴道炎症。阴道炎最常见的致病菌是滴虫、念珠菌、细菌等，在育龄女性同样高发。阴道炎症状可表现为外阴痒、灼痛、排尿痛、性交痛、白带异常等不适。
甲硝唑对滴虫性阴道炎、细菌性阴道病均有治疗效果。由于女性99%的盆腔炎性疾病由阴道或宫颈菌群上行感染所致，包括需氧和厌氧菌，两者混合感染多见，所以盆腔炎性疾病抗炎治疗常需要加用甲硝唑。但是任何疾病都需要前往医院就诊，明确诊断后再行用药。
