艾司奥美拉唑可以治疗胃溃疡，胃溃疡主要是由于胃酸和胃蛋白酶对胃黏膜的消化作用，导致溃疡发生。
胃体分泌胃酸部位位于胃体B细胞，此处质子泵可促进胃酸分泌，艾司奥美拉唑为质子泵抑制剂(PPI)，可抑制B细胞内质子泵的作用，从而减少胃酸分泌，减弱对胃黏膜的消化作用，有利于预防溃疡发生，以及纠正、治疗胃溃疡。
除艾司奥美拉唑以外，胃溃疡治疗还有较多药物，如H2受体拮抗剂，可减少胃酸分泌，若胃溃疡由幽门螺杆菌感染引起，选用PPI或铋剂同时，还需选择两种抗生素，组成四联幽门螺杆菌清除方案来清除幽门螺杆菌，亦可治疗和降低胃溃疡发生风险。
除药物治疗外，胃溃疡还需饮食治疗，如忌酒、少饮咖啡和浓茶、饮食规律、少吃或不吃辛辣、刺激食物，饮食疗法和药物疗法相结合，才能有效治疗溃疡，并且预防溃疡复发。
