结肠透析的具体作用，是帮助病人排出体内多余的毒素。很多物质都可以在结肠被吸收，这时把过滤以后的水经过直肠打入结肠后，第一个，可以阻止过多的毒素从结肠吸收进人体内，第二个，结肠也可以作为一个半透膜，把血液中的一些毒素吸收到结肠透析液中，可以发挥一定的净化作用，这是结肠透析的特点。
结肠透析对于清除体内的中分子毒素、大分子毒素，包括小分子毒素，都有一定的优势，特别是对于清除体内中、大分子的毒素，效果比血液透析效果要好。但是也还是应该能看到，结肠透析毕竟结肠交换的面积没有很大，所以这时结肠透析排毒的作用没有很强。
其通常用于肾功能不全早期的病人，即肌酐在100-200μmol/L时，可以帮助病人排出体内多余的毒素、延缓肾功能不全的进展，对病人的病情有一定好处。另外排出毒素后，也会对病人的消化系统，以及各个系统都有一定较好的影响。
