检查乙肝五项的目的主要是查患者有无乙肝病毒感染，以及对乙肝有无免疫性和有无保护性抗体。医院里医生经常会要求检查乙肝五项，比如做胃镜、拔牙、手术、输血之前等，或者还要加上丙肝、梅毒、艾滋，因为这都是中国重要的传染病。这时检查乙肝五项的目的是把乙肝阴性和阳性的患者分开，乙肝五项如果是阴性，可能用一条胃镜；乙肝五项如果是阳性，可能用另外的胃镜或者消毒程序有所不同，做手术可能也有差别。乙肝五项阳性的病人，也许所用的手术铺巾、单子、被单等都是一次性的，不用消毒，可以直接抛弃。
乙肝五项最重要的意义是确定病人有无乙型肝炎，有乙型肝炎和没有乙型肝炎在医学上的处理存在区别。另外查乙肝五项要看有无表面抗体，这代表患者对乙肝有无免疫力。现在国家政策主张所有人打乙肝疫苗，以防止感染乙型肝炎。为了诊断自身有无乙肝免疫力，可进行乙肝五项检测。
