肠道包括小肠和结肠，有很多检查方法，应根据不同的病情特点，选择合适的检查。结肠相关检查有钡剂灌肠、结肠镜、胶囊结肠镜，也可通过初筛的方法，比如做大便化验，包括大便常规、潜血，帮助明确病因。小肠相关检查有胶囊的小肠镜，通过吞入一个微型摄像机胶囊，观察小肠黏膜的情况。
目前也有小肠镜，包括单气囊小肠镜、双气囊小肠镜，小肠镜和普通的胃镜、肠镜一样，由医生进行操作，进行完整的小肠的观察，同时能做一定的治疗。影像学的检查，比如CT，也可进行肠道的检查。肠道有占位性病变或者肠壁环周的肿胀，CT、超声等影像学检查可以帮助发现病变。CT还可以做进一步的肠道重建，扫描后经过后期处理，完成肠道重建，更好地观察肠道的情况。
