艾灸盒的使用方法，相对较为简单。主要是打开艾灸盒以后，点燃内部的艾条，然后合上艾灸盒的盖子，固定至体表的部位即可。艾灸盒有简单的，也有复杂的，简单的通常是木盒，可以合上盖子，放置在腹部、腰背部等较为平坦的部位。还有相对比较复杂的，例如艾柱，可以直接插到灸盒上，再沿脊柱排列，可以进行督脉灸。
另外有艾灸盒更为复杂，可以进行控温，即通过调节风力的大小，控制艾灸的氧气，直接影响到艾灸的燃烧火力和艾灸的时间，可以调节艾灸发散的热量和艾灸时间的长短。有的艾灸盒较为简单，只能放置在体表较为宽阔的部位，但是有的配有固定装置，可以直接固定于腿部、膝关节，外周存在固定带。
