耳朵根肿痛可能的原因是腮腺炎、腮腺肿物、淋巴结肿大、肿瘤性病变等，具体如下：

1、腮腺炎：因为耳朵根这个地方是腮腺所在的部位，不明原因的病毒或者细菌感染可引起腮腺炎，出现耳朵根肿痛；

2、腮腺肿物：如腮腺结石、腮腺良性肿瘤、腮腺混合瘤或者是腮腺的恶性肿瘤等，为了排除这些病变，需要做腮腺的超声看腮腺里边到底是出现了什么样的病变；

3、淋巴结肿大：可能是耳后以及耳下的淋巴结肿大，因为耳后及耳下这个部位淋巴结比较丰富，当耳朵周围有一些病变，可能会导致这些淋巴结肿大。可能的病变是炎症性病变，包括急性咽炎、鼻窦炎以及急性扁桃体炎、急性会厌炎、急性喉炎等，都可能会导致耳后的淋巴结肿大，还有耳朵的炎症比如急性中耳炎、外耳道炎等；

4、肿瘤性病变：还有一种可能的病变是肿瘤性的病变，比如鼻咽癌或者是下咽癌、喉癌等，都有可能会引起耳后的肿痛。

所以一旦出现耳朵根肿痛，要做超声看一下病变的大概性质，比如是腮腺还是耳后的淋巴结，如果是腮腺，是什么病变，如果是耳后淋巴结肿大，大概是炎症性还是转移性病变。