引起后脑勺疼痛的原因很多，包括颅内的因素、颅外的因素以及血管方面的因素，需要进行相关检查以区别三个因素，常用检查包括头部、颈椎的核磁共振，以及椎动脉和颈动脉的超声。
通过这些检查后，可明确后脑勺疼痛是由于颅内的梗塞或出血，或脑血管畸形，还是因为颅外颈动脉或椎动脉因素、颈部的椎间盘突出压迫或者刺激如枕大神经等，从而出现后脑勺疼痛。
通过相关检查，查出导致后脑勺疼的原因后就可选择用药。如果为短期且以颅外因素为主，如颈椎的椎间盘突出刺激枕大神经，这时可用非甾体类抗炎药和局部肌肉放松的药物进行治疗。如果是颅内或血管方面的因素，需要到相关的专科进行处理。
