脊髓损伤针灸治疗部位主要有局部、远端及支配的肌肉，确定脊髓损伤层面节段或者出现脊髓损伤的节段，选择相应夹脊穴进行针刺，而且为电针治疗。
在该节段进行穴位注射，局部注射甲钴胺、神经生长因子等神经营养药物，可能会对中枢神经或周围神经有营养作用。选择脊髓损伤层面以下的瘫痪肌肉，进行针刺。
如果出现下肢瘫痪，可以选用每块肌肉的两个点，对下肢瘫痪肌肉进行针刺，接电针进行治疗。如果脊髓损伤出现大小便障碍，也可以通过针刺改善大便和小便障碍功能状态。
通常小便障碍会选择中极、关元、水道穴。大便障碍会选择天枢穴，后背通常会选择脾俞穴、胃俞穴、三焦俞、大肠俞、关元俞以及八髎穴进行针刺。
脊髓损伤要在损伤节段进行治疗，在损伤相应的肌肉节段进行治疗，选择相应器官进行治疗。
