声带囊肿的手术几乎没有痛苦，手术是在全身麻醉下进行，主要在支撑喉镜下使用显微镜，同时使用纤维器械或激光进行囊肿切除。声带囊肿切除过程中，主要将声带囊肿完整剥离以后，将囊壁彻底切除，从而防止再次发作。通常可以使用显微剪刀切除声带囊肿，也可以使用激光切除囊肿，特别是二氧化碳激光。

声带囊肿手术以后，通常需要进行雾化吸入治疗，同时需要休声，即3-7天尽量少说话，使声带得以休息，可以使伤口尽快愈合。1周之内禁食辛辣、刺激食物，同时需要禁烟、禁酒，促使声带较快恢复正常状态。通常1个月左右，即可达到正常发声。