胃镜活检是胃镜检查时通过活检孔道使活检钳进入胃腔，然后在胃黏膜局部钳取一块较小的组织，进一步做病理学检查。此检查通过福尔马林浸泡后制作蜡片，再进行切片、染色，必要时可做免疫组化，对疾病做出判断。
胃镜活检是临床上帮助诊断胃病的重要手段，如胃镜下局部黏膜呈现萎缩、黏膜变薄或黏膜下血管透见等表现，或者局部增生样改变，在内镜下看到典型肠化亮蓝嵴表现。此时需进一步取活检胃组织，再送病理科，进一步验证有无腺体减少或肠上皮化生的病理改变。如果存在相对恶性的病变，在镜下观察是否为胃癌，需取活检送病理，最终由病理科医生在显微镜下观察有无肿瘤细胞腺体结构，是否存在排列异常，有无肿瘤细胞分化，为高分化、中分化还是低分化，此时胃镜活检病理都可帮助进一步确诊。
