在理论上，接种4价疫苗以后，可以接种9价疫苗。但临床实践上，这类做法较为少见，可能属于浪费资源。4价疫苗与9价预苗存在较大区别，9价疫苗除覆盖4价疫苗的4种HPV亚型，还包括其他5种HPV亚型阳性。所以9价疫苗对HPV感染的预防作用更强。
接种4价疫苗后，在理论上可以继续接种9价疫苗，两者并无明显冲突。并且接种9价疫苗，可以额外预防其他5种HPV亚型感染。但是在临床实践上，这类做法较为少见。一方面可能属于浪费资源，另一方面4价疫苗与9价预苗的适应症不同。主要为年龄的适应症，通常4价疫苗建议20-45岁接种，而9价预苗建议16-26岁接种。
