反复长结石的原因根据结石的类型不同而不同，具体如下：

1、胱氨酸结石：儿童的胱氨酸结石是由遗传因素所造成，因为染色体一些片段的缺失导致胱氨酸不能够被完全代谢，在尿液当中含量增加而引起胱氨酸结石；

2、尿酸结石：由于尿酸代谢异常，使体内血液中的尿酸含量增加、尿液中尿酸盐沉积过多导致尿酸结石；

3、草酸钙结石：是对草酸的代谢异常，一部分是由遗传基因造成，另一部分是由自身代谢因素造成，是血液、尿液中的草酸含量增加，形成草酸结石。还有一部分是对钙的代谢异常，某些疾病，如甲状旁腺疾病、甲状腺瘤、甲状旁腺功能异常引起血液、尿中钙的含量增高，引起的草酸钙结石反复发作；

4、感染性结石：尿路反复感染引起尿液中感染性结石反复发作。

此外，结石本身在肾脏里，由于畸形变、输尿管狭窄等因素，导致结石不能排空，也是结石反复发作的原因。同时结石没有取干净，结石的晶核依然存在，也可以导致结石反复复发。针对不同结石复发的原因采取不同的措施，才能够使结石复发进行有效的遏制。