幽门螺杆菌的检查主要有血清学检查、粪便检查以及尿素呼气试验检查，在进行检查之前首先要确定近期没有吃过抗生素、铋剂以及强制酸药，包括对幽门螺杆菌有抑制作用的中药，这些药应该至少停用一个月。如果是强制酸药，也可以停用两周，然后才可以进行检查。

在临床上做呼气试验来检测幽门螺杆菌的非常多，做呼气试验检查时，首先要空腹，因为进食以后，胃里面的食物不能保证做呼气试验时吃的碳13，或碳14胶囊的尿素和胃黏膜存在的细菌能够有很好的接触，所以可能会出现假阴性的结果。另外，做呼气试验之前或在等待检查的过程中，应该尽量避免运动，尤其是剧烈运动，因为过快的运动会增加黏膜血流，会增加胃排空，也会出现假阴性。另外，在做呼气试验吹气时，尤其是服用药物第二次吹气时，有的病人可能会深吸一口气，然后再去吹气，这时也会影响到检测的呼气值，还有吹气的袋子漏气也会影响检测结果，这些都是在进行幽门螺杆菌检查的过程中应该注意的事情。