肾结石3×3mm并不严重，其结石体积较小，并不属于严重的结石范围。肾结石如果直径在6mm以下，属于较小的结石。此类结石具有较高的自发排石率，患者仅需要多饮水、多排尿、适当增加运动，有些患者可以应用中药排石汤，以进行辅助排石。但需要注意的是多饮水、多排尿，是关注患者的尿量，并非患者的饮水量。患者仅需多饮水，使24小时尿量达到2000ml以上，即可显著增加结石的排出概率。
除此之外，患者还应适当增加运动，其中以全身运动、震荡性运动为主。震荡性运动是指跑跳、上下楼梯、跳绳，这些运动均有利于结石的排出。除多饮水、多运动之外，还可以辅助中药排石，常用的中药包括金钱草、海金沙、石苇、具麦等。另外中成药也具有一定的辅助排石作用，如排石颗粒、尿石通丸等中成药，也具有一定的辅助排石作用。
