幻听、幻觉的原因目前尚不清楚，已知的一些资料可能是与脑内多巴胺的代谢有关，可能跟脑内异常的放电有关，还可能跟脑内神经递质的紊乱有关。目前属于病因的探索阶段，原因非常多，但并不能够非常准确的回答是什么原因导致。
最常见的两个问题，比如癫痫，就出现幻听、幻嗅这些幻觉，可能与颞叶这个位置的异常电信号有关。另外比如脑血管病，脑血管病可能也会出现这样一些幻觉、幻听，可能与细胞的供血、血供有关。
还可能与功能性有关，如有精神分裂症，与多巴胺的代谢有关，多巴胺功能亢进就可能会出现幻听、幻觉。还有功能性的病变，比如在一些术后的病人，或者是麻醉刚醒的病人，可能就会出现幻觉和幻听。这种可能与短暂的脑功能不好有关，存在缺氧、循环障碍等，包括一些外原的药物副作用，也可能会出现。
