腭裂原则上选择腭裂修复术进行治疗，但腭裂患儿可伴发心脏等先天性疾病，需要做好术前检查，才能选择合适的手术时机。
腭裂手术原则上需要选择既可关闭上腭裂隙，又对上颌骨生长发育影响比较小的手术方法。恢复腭裂手术的基本原则是延长软腭，增加腭咽闭合，恢复正常吞咽和发音功能。
因此腭裂手术建议选用既能有效恢复腭裂患儿语音，又能对上颌骨生长发育影响较轻的手术方法。在唇腭裂修复术的同期，进行硬腭离骨瓣修复，既可有效缩窄腭裂的裂隙宽度，又可降低后期腭裂手术的难度。
建议优先选用腭帆提肌重建法、双向反Z法以及将二者结合使用的术式等，操作应遵循重建腭帆提肌环的形态结构，延长软腭长度，尽量避免和减少术后暴露硬腭来裸露骨面，以免影响上颌骨发育。
腭裂的治疗应遵循序列治疗原则，给患儿治疗腭裂的同时，积极进行心理康复。
