HLA-B27基因是和强直性脊柱炎关系特别密切，以至于很多的人都会觉得这两个一致。但二者关系其实并不密切。强直性脊柱炎的患者，90%的HLA-B27阳性，也就是还有10%的病人是HLA-B27阴性，但并不患病。
即使HLA-B27阳性，其实得强直性脊柱炎的风险也非常低，主要还是要结合患者的症状，有没有特别典型的强直性脊柱炎的腰疼、背疼、臀部疼痛症状。还有一个很关键的点是有没有相关辅助检查的异常，比如有没有炎症指标升高，有没有在核磁下看到骶髂关节确实有骨髓水肿的炎症性表现。症状加影像学的表现，才能诊断强直性脊柱炎，此时反而跟HLA-B27是不是阳性没有特别密切的关系。
