行胃镜检查一般不会传染疾病。胃镜的洗消有全国统一、严格的规范与标准，在做胃镜之前，所有患者均要常规进行传染性疾病的检查，比如乙肝、丙肝、艾滋病、梅毒，会在术前进行检查。传染病患者，会使用专门的检查器械以及洗消流程。

消化道是一个清洁的环境，但不是无菌的环境，患者进食的食物也并非无菌，因此使用的胃镜保持清洁即可，不要求无菌。临床做胃镜检查较为安全，一般不会出现传染病的问题。