唇腭裂患者经手术治疗以后，会遗留手术痕迹，即俗称的瘢痕。瘢痕亦为所有唇腭裂患儿的家庭成员，以及其本人较为关心的问题。因为对于唇腭裂患者而言，手术治疗完成以后，唇腭裂的裂隙即可被修复，但是术后遗留的痕迹可严重影响患者的容貌，甚至患者的内心，并且可影响患者的社交，以及患者踏入工作以后的整个心理状态。
目前对于瘢痕，无任何办法可以将之消除，市面上有部分方法，或者产品声称可将瘢痕祛除均无科学依据。患者术后仅可通过手术修复、辅助用药，甚至于激光等手段对瘢痕进行整复。整复的内在含义指使瘢痕变得更细、更淡、更美观，但是无任何办法可以将手术修复以后遗留的瘢痕消除。因此，唇腭裂患儿就诊时，医生一定要与患儿的家属说明术后瘢痕无法消除的问题，使患者接受治疗前即有心理预期，同时亦需要告知患者不能相信夸大、虚假的宣传，因为唇腭裂患者行手术治疗，所遗留的瘢痕可以祛除并不真实。
